இந்தக் கோயில் கி.பி 8 ஆம் நூற்றாண்டின் பிற்பகுதியில் இடைக்கால சோழர்களால் கட்டப்பட்டதாக நம்பப்படுகிறது , பின்னர் தஞ்சாவூர் நாயக்கர்களின் பங்களிப்புகள் வெவ்வேறு காலங்களில் உள்ளன . இந்தக் கோயிலில் சோழர் காலத்தைச் சேர்ந்த இரண்டு கல்வெட்டுகள் உள்ளன. இந்தக் கோயிலில் ஒரு கிரானைட் சுவருக்குள் ஐந்து நிலை ராஜகோபுரம் (நுழைவாயில் கோபுரம்) உள்ளது. இந்த வளாகத்தில் அதனுடன் தொடர்புடைய அனைத்து சன்னதிகளும் நீர்நிலைகளும் உள்ளன.
சௌந்தரராஜப் பெருமாள், மார்க்கண்டேயர் , துருவர் , சலீசன் மற்றும் பூதேவி ஆகியோருக்காக அவதரித்ததாக நம்பப்படுகிறது . இந்தக் கோயில் தினசரி ஆறு சடங்குகளையும், மூன்று வருடாந்திர விழாக்களையும் கடைப்பிடிக்கிறது. தமிழ் மாதமான சித்திரையில் (மார்ச்-ஏப்ரல்) கொண்டாடப்படும் தேர் திருவிழா, கோயிலின் மிக முக்கியமான திருவிழாவாகும். இந்தக் கோயில் தமிழ்நாடு அரசின் இந்து சமய மற்றும் அறநிலைய வாரியத்தால் பராமரிக்கப்பட்டு நிர்வகிக்கப்படுகிறது .
காவிரி நதியின் கிளை நதியான ஓடம்போக்கி , கோயிலுக்கு அருகில் செல்கிறது, மேலும் இந்த நதி விருத்த காவேரி என்றும் அழைக்கப்படுகிறது. இது தலைமை தெய்வத்தின் பெயர்களில் ஒன்றான "காவேரி துறைவன்" க்கு வழிவகுக்கிறது. இன்றைய நாகப்பட்டினம் ஒரு காடாக இருந்ததாக நம்பப்படுகிறது, வரலாற்று ரீதியாக சுந்தராரிண்யம் என்று பெயரிடப்பட்டது. திரேதா யுகத்தில் ஒரு இளவரசர் துருவன் , காட்டின் முக்கியத்துவத்தைப் பற்றி கேள்விப்பட்டு, விஷ்ணுவைக் காண விரும்பி தவம் செய்யத் தொடங்கினார் . இந்த தவத்தால் மகிழ்ச்சியடைந்த விஷ்ணு அவருக்குத் தோன்றினார். அவரது முன்மாதிரியைப் பின்பற்றி, மார்க்கண்டய மகரிஷி தவம் செய்து சத்ய யுகத்தில் விஷ்ணுவின் தரிசனத்தையும் , திரேதா யுகத்தில் விஷ்ணுவின் மனைவியான லட்சுமியையும், கலியுகத்தில் மன்னர் சலீச சோழனும் தவம் செய்து தரிசனம் பெற்றார் . கண்டன் மற்றும் சுகந்தன் என்ற இரண்டு அண்ணகர்கள் கோயில் குளமான சார புஷ்கரணியில் புனித நீராடிய பிறகு உடல் ஆரோக்கியத்தை அடைந்ததாக நம்பப்படுகிறது. படைப்பின் இந்து கடவுளான பிரம்மா இந்த இடத்தில் விஷ்ணுவை வழிபடத் தொடங்கினார். விஷ்ணு மாசி மகாமத்தின் புனித நாளில் சரபுஷ்கரணி கரையில் தோன்றியதாக நம்பப்படுகிறது . மாசி மகாமத்திலிருந்து வெளிப்படும் ஒளியின் காரணமாக, இந்த இடத்தில் விஷ்ணு "அழகியான்" என்று அழைக்கப்பட்டார். அவர் பளபளப்பான தோலைக் கொண்டிருந்ததால், அவர் "சௌந்தர ராஜன்" என்று அழைக்கப்பட்டார், அதாவது மிகவும் அழகானவர் என்றும், அவரது துணைவி சௌந்தரவல்லி என்றும் அழைக்கப்பட்டார். நாகர்களின் (பாம்புகளின்) ராஜாவான ஆதிசேஷர் இந்த இடத்தில் விஷ்ணுவை வழிபட்டதால், இந்த இடம் நாகர் பட்டினம் என்று அழைக்கப்பட்டது, இது நாகர்களின் இடம்.
8 முதல் 10 ஆம் நூற்றாண்டுகளில் பல்லவர்கள் , நாகர் மற்றும் சோழர்கள் இந்தக் கோயிலுக்குப் பங்களித்தனர் . பிந்தைய நூற்றாண்டுகளில், தஞ்சாவூர் நாயக்கர்களும் அதைத் தொடர்ந்து தஞ்சாவூர் மராத்தியர்களும் கோயிலுக்கு குறிப்பிடத்தக்க பங்களிப்புகளைச் செய்ததாக நம்பப்படுகிறது. நாயக்கர்களின் ஆட்சியின் போது, நாகப்பட்டினம் ஒரு பரபரப்பான துறைமுகமாக இருந்தது, மேலும் இது ஒரு டச்சு பிரதேசமாக இருந்தது. டச்சுக்காரர்களின் கலங்கரை விளக்கத்திற்கான வேண்டுகோளின் பேரில், நாயக்க மன்னர் ஏழு நிலை கோயில் கோபுரத்தைக் கட்டி அதை கலங்கரை விளக்கமாகப் பயன்படுத்தியதாக நம்பப்படுகிறது. 1650 களில் ஒரு நாயக்க மன்னரின் லெப்டினன்ட்டாக இருந்த ஜகுல் நாயக்கர், சௌந்தரராஜ பெருமாளின் தீவிர வழிபாட்டாளராக இருந்தார். கோயில் கோபுரம், மண்டபங்கள் மற்றும் கோயிலைச் சுற்றியுள்ள சுற்றுச்சுவரை அவர் கட்டியதாக நம்பப்படுகிறது. அவர் மற்றும் அவரது மனைவி லட்சுமி அம்மாளின் உருவம் அவர்களால் கட்டப்பட்ட மண்டபங்களில் ஒன்றில் நிறுவப்பட்டுள்ளது. 1737 ஆம் ஆண்டு நாயக்கர் பேரரசின் அதிகாரியான குண்டோ பண்டிதர், அஷ்டான மண்டபத்தையும், பச்சை வர்ணர், பாவள வண்ணார், வெற்றியிருந்த பெருமாள், கிடாந்த கோலப் பெருமாள் மற்றும் விஷ்வக்சேனர் சன்னதிகளையும் கட்டியதாக நம்பப்படுகிறது. 20ஆம் நூற்றாண்டின் முற்பகுதியில் திராட்ச பாலகுருமுடி செட்டியார் பக்திஉலா மண்டபத்தையும், சின்னையா செட்டியார் வசந்த மண்டபத்தையும், நாச்சியப்பப் பிள்ளை மாடைப்பள்ளியையும், ராமசாமிப் பிள்ளை தலைமைச் சன்னதியின் திருவுருவத்தையும் புதுப்பித்து, நகரின் குடிமக்கள் பல்வேறு திருப்பணிகளுக்குப் பங்களித்தனர். கோவிலின் பராமரிப்புக்கு செய்த பங்களிப்புகள் குறித்து பல்வேறு ஆளும் பேரரசுகளின் கல்வெட்டுகள் உள்ளன.
தென்னிந்திய மாநிலமான தமிழ்நாட்டில் உள்ள நாகப்பட்டினத்தில் இந்தக் கோயில் அமைந்துள்ளது . கோயிலின் பிரதான நுழைவாயில் கிழக்கு நோக்கி உள்ளது, மேலும் கோயிலின் நுழைவாயிலில் நான்கு தூண்களைக் கொண்ட திறந்த மண்டபம் உள்ளது. கோயிலில் 90 அடி (27 மீ) உயரமான ராஜகோபுரம் (கோயில் கோபுரம்) உள்ளது மற்றும் அதைச் சுற்றி செவ்வக சுவர்களால் சூழப்பட்டுள்ளது. மேற்குப் பக்கத்தில் ஒரு சிறிய கோயில் கோபுரம் உள்ளது. கோயிலின் சுவர்கள் பெரிய தெருக்களால் சூழப்பட்டுள்ளன, இதன் மூலம் கோயில் தேர் திருவிழாக்களின் போது செல்கிறது. தெற்குத் தெருவில் கோயில் தேர் மற்றும் சரபுஷ்கரணி, கோயில் குளத்தின் நிலை ஆகியவை உள்ளன. எட்டு கைகளுடன் நரசிம்மரின் அரிய உருவம் , ஒன்று பிரஹ்லாதனை ஆசீர்வதிக்கிறது, மற்றொன்று அபய முத்திரையைக் காட்டுகிறது மற்றும் அசுரன் , ஹிரண்யகசிபுவைக் கொன்றதில் ஈடுபட்ட மற்றவை , கோயிலில் உள்ளன. சௌந்தர்வல்லி கோயிலின் சன்னதிக்கு முன்னால் நான்கு தூண்களைக் கொண்ட ஒரு மண்டபம் உள்ளது, இது அழகான கட்டிடக்கலை சிகிச்சையைக் கொண்டுள்ளது. மண்டபத்தில் அதை வடிவமைத்த கட்டிடக் கலைஞர்களின் உருவங்கள் உள்ளன. நாயக்க மண்டபம் வெளியே சக்கரங்களுடன் கூடிய தேர் போல கட்டப்பட்டுள்ளது. கோயிலின் நுழைவாயிலைக் கொண்ட மண்டபத்தில் சும்பா மற்றும் நிகும்பா காவல் தெய்வங்களின் இரண்டு எட்டு அடி சிற்பங்கள் உள்ளன.
தமிழ் மாதமான சித்திரையில் , கோயில் வளாகத்தில் இந்து நாட்காட்டி வாசிக்கப்பட்டு, கோயிலின் மாட வீதியைச் சுற்றி திருவிழா தெய்வம் ஊர்வலமாக எடுத்துச் செல்லப்படுகிறது. சித்திரை மற்றும் மகம் ஆகிய மாதங்களின் மாகா நட்சத்திரத்தின் போதும்; தமிழ் மாதமான ஆனி மாதத்தில் நம்மாழ்வாரின் ஐந்து நாள் திருவிழாவின் போதும் இதேபோன்ற ஊர்வலங்கள் பின்பற்றப்படுகின்றன . அதே மாதத்தில், கொடி ஏற்றப்பட்டு, தாயாரின் பண்டிகை உருவம் கோயிலின் தெருக்களைச் சுற்றி வெவ்வேறு ரதங்களில் எடுத்துச் செல்லப்படும் போது, பத்து நாள் ஆண்டுதோறும் சௌந்தரவல்லி தாயாரின் திருவிழா கொண்டாடப்படுகிறது. உத்திர நட்சத்திரத்தின் போது, பெருமாள் தாயாரின் சன்னதிக்கு வந்து தெய்வீக திருமணம் கொண்டாடப்படுகிறது. தமிழ் மாதமான ஆடி மாதத்தில் , கோடைகால சங்கிராந்தியை நினைவுகூரும் வகையில், கோயிலில் பத்து நாள் திருவிழா கொண்டாடப்படுகிறது, அப்போது பெருமாளின் திருவிழா உருவம் கோயிலின் தெருக்களில் எடுத்துச் செல்லப்படுகிறது. கிருஷ்ண ஜெயந்தி, தமிழ் மாத புரட்டாசி சனிக்கிழமைகள், நவராத்திரி , வைகுண்ட ஏகாதசி மற்றும் விஜயதசமி போன்ற விஷ்ணு கோயில்களுடன் தொடர்புடைய பிற திருவிழாக்கள் அந்தந்த நாட்களில் கொண்டாடப்படுகின்றன. தமிழ் மாதமான புரட்டாசியில் மணவாள மாமுனிகளின் நினைவாக பத்து நாள் திருவிழா கொண்டாடப்படுகிறது. தமிழ் மாதமான தை மாதத்தில் உத்திரயானபுண்யகாலம் , அதைத் தொடர்ந்து மாட்டையடி, மாசியில் மாசி கடலுட்டு, பங்குனியின் போது பங்குனி பெருவிழா மற்றும் திருவாசகை விழா ஆகியவை இக்கோயிலில் நடைபெறும் மற்ற முக்கிய திருவிழாக்கள். சுத்தமாதலம், ஏக்களம், திருச்சின்னம், தலம் போன்ற இசைக்கருவிகள் இத்தகைய விழாக்களில் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. திருவாசி திருவிழாவின் போது, கோவில் தேர், கோவில் வீதிகளில் வலம் வரும்.
பிரம்மாண்ட புராணத்தில் உத்தரகண்ட ஞான யோகப் பிரிவில் இந்தக் கோயில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளது . திருமங்கை ஆழ்வார் எழுதிய 7-9 ஆம் நூற்றாண்டு வைணவ நியதியான நாலாயிர திவ்ய பிரபந்தத்தில் இந்தக் கோயில் போற்றப்படுகிறது . திருமங்கை ஆழ்வார் பார்வையிட்ட முக்கியமான கோயில்களில் ஒன்றாக இது கருதப்படுகிறது. ஆழ்வார் தன்னை ஒரு பெண்ணாகவும், சௌந்தராஜரை தனது காதலராகவும் கற்பனை செய்து கொண்டு புகழ் பாடியுள்ளார். இந்தக் கோயில் திவ்ய தேசமாக வகைப்படுத்தப்பட்டுள்ளது , இது புத்தகத்தில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ள 108 விஷ்ணு கோயில்களில் ஒன்றாகும். பல ஆச்சாரியர்கள் இந்தக் கோயிலில் உள்ள சௌந்தராஜரின் பல்வேறு வடிவங்களைப் பற்றியும் பாடல்களை எழுதியுள்ளனர். திவ்யகவி பிள்ளை பெருமான் தனது நோத்ரியேட்டு திருப்பதி கோவை மற்றும் பரவை ராமானுஜர் ஆகிய படைப்புகளில் நோத்ரியேட்டு திருப்பதி கோவை மற்றும் பரவை ராமானுஜர் ஆகிய படைப்புகளில் தலைமை தெய்வத்தை வணங்கியுள்ளார் . 20 ஆம் நூற்றாண்டின் முற்பகுதியில் இருந்த கவிஞரான முத்துகிருஷ்ண தாசர், பஞ்சரத்ன பதிகத்தில் தனது படைப்புகளில் சௌந்தரராஜப் பெருமாளையும் சௌந்தரவல்லியையும் போற்றியுள்ளார் . சௌந்தரராஜப் பெருமாள் தசாவதார பதிகம் என்பது சுப்பராயப்பிள்ளையின் மூலஸ்தானத்தைப் பற்றிய படைப்பு. மூன்று சங்கீத மூர்த்திகளில் ஒருவரான முத்துசுவாமி தீட்சிதர் , தெய்வத்தைப் புகழ்ந்து பாடியுள்ளார்.